Die größtmögliche Kompatibilität der Apps bietet nur ein google-zertifiziertes Android (wie Fairphones offizielles “Android OS”). Ich selbst bin kein Power User und von daher genügsam (nutze z.B. keine Banking-App), bei mir funktioniert nur eine App nicht, die ich gerne nutzen würde (Elektronische Patientenakte, akzeptiert ausschließlich Google-System). Bei Banking-Apps ist es nicht generell zu sagen – hängt von der konkreten App ab.
Das FP5 würdest Du nur noch gebraucht bekommen. Das FP6 ist wieder ein Stückchen kleiner als das FP5. Das Gerät als Herz eines Computersystems zu nutzen geht hingegen nur mit dem FP5 (wg. USB-Anschluss niedrigeren Standards im FP6).