Ja, das sollte normalerweise nur einige Minuten in Anspruch nehmen.
Wenn es geklappt hat, würde ich Dir dazu raten, erst mal nur die Banking-App, die Dir wichtig ist, zu installieren und zu testen. Es ist gut möglich, dass sie auf dem letzten Fairphone OS gar nicht läuft (Android 4.2.2). Wenn das der Fall ist, gibt es aber noch eine neuere, nicht-offizielle Version aus der Community, die eine Umsetzung von Android 4.4.4 für das Fairphone beinhaltet.
Ach ja, und um ganz sicher zu gehen: Dein Backup ist auf einer SD-Karte oder einem Computer und nicht auf dem internen oder dem Telefonspeicher, richtig? Sonst wäre das ja für die Katz. 